El programa Terrena tiene 4 líneas básicas:

• Linea 1. Gestión Integral de los recursos hídricos. Que a su vez se divide en 3 partes:
  • Abastecimiento de agua potable y saneamiento.
  • Promoción de actividades productivas compatibles con el uso sostenible del recurso hídrico.
  • Mecanismos de conservación y protección ambiental
• Línea 2. Prevención y mitigación de riesgos a escala local y municipal
• Linea 3. Fortalecimiento institucional para la mejora de las capacidades locales orientadas a la ordenación y planificación del territorio con enfoque de cuenca. 
• Línea 4. Promoción y difusión de tecnologías apropiadas y modelos de gestión sostenible de los recursos naturales en el medio rural centroamericano.